Boletín Mensual de Monitoreo Legal y Regulatorio Pesquero. Septiembre 2026

Manriquez y cia Abogados Pablo Manriquez Diaz

29 sept

13 min de lectura

Actualizado: 30 sept

Septiembre 2026 · Manríquez & Cía. Abogados

Septiembre mostró una administración pesquera especialmente activa en materias de acceso, fiscalización y condiciones de operación. El jurel concentró nuevas medidas sobre talla mínima, áreas de resguardo y acreditación de origen; mientras que en los pequeños pelágicos continuaron las cesiones, redistribuciones y ajustes vinculados al Régimen Artesanal de Extracción. Al mismo tiempo, el proceso anual de caducidades del Registro Pesquero Artesanal cerró su etapa de audiencia previa y quedó a la espera de las decisiones definitivas de Sernapesca.

El mes dejó además dos pronunciamientos jurídicos relevantes para el sector. La Dirección del Trabajo precisó las consecuencias remuneracionales del traspaso de cuotas cuando existen contratos de trabajo o contratos a la parte, mientras la Contraloría fijó límites al uso de convenios de colaboración con entidades privadas para la elaboración de Planes Generales de Administración de parques y reservas marinas. En el Congreso, tanto el proyecto sobre jibia como el relativo al fortalecimiento de la seguridad marítima continuaron avanzando, aunque sin modificar todavía el régimen vigente.

La agenda internacional también tuvo presencia. Roma acogió el 37° Comité de Pesca de la FAO, donde se discutieron algunos de los principales desafíos de la gobernanza pesquera mundial y Chile fue elegido para presidir el próximo período del Comité. En acuicultura, la principal novedad fue sanitaria: la detección de virus ISA en Aysén derivó en la delimitación de una zona infectada y una zona de vigilancia.

Principales hitos

1️⃣ Jurel: septiembre refuerza el control de talla mínima y la trazabilidad

Durante septiembre continuó la aplicación del protocolo transitorio de áreas de resguardo aprobado en julio para la pesquería de jurel, mecanismo orientado a evitar la captura de ejemplares bajo talla mínima mediante alertas y desplazamientos temporales de las zonas de pesca. A comienzos del mes comenzó a regir un nuevo polígono de resguardo frente al Biobío, luego de detectarse porcentajes elevados de ejemplares juveniles.

A ello se sumó la Res. Ex. N° 2121-2026, publicada el 4 de septiembre, que modificó el método de control de los márgenes de tolerancia asociados a talla mínima para jurel y sardina española. Posteriormente, la Res. Ex. DN N° 02784/2026 de Sernapesca estableció un procedimiento específico para acreditar el origen legal del jurel fresco y enfriado-refrigerado en Arica y Parinacota, Tarapacá, Antofagasta, Atacama y Coquimbo.

🔎 Impacto. Las medidas no modifican la cuota de jurel, pero refuerzan el control en distintas etapas de la cadena: operación de la flota, cumplimiento de la talla mínima y trazabilidad posterior al desembarque. Para armadores, transportistas, compradores y plantas aumenta la importancia de revisar tanto las condiciones efectivas de captura como el respaldo documental del recurso. El conjunto debe seguirse además en un año en que las condiciones oceanográficas han incidido en la disponibilidad y composición de las capturas.

2️⃣ Registro Pesquero Artesanal: concluye la audiencia previa del proceso de caducidades 2026

El 15 de septiembre venció el plazo ampliado para que pescadores artesanales y armadores incluidos en las nóminas preliminares de caducidad pudieran aportar antecedentes destinados a desvirtuar las causales informadas por Sernapesca. La ampliación había sido dispuesta mediante la Res. Ex. DN N° 02372/2026, que modificó la Res. Ex. DN N° 01865/2026 que dio inicio al procedimiento.

El proceso tiene especial relevancia porque comprende las distintas causales de caducidad contempladas en el artículo 55 de la Ley General de Pesca y Acuicultura. Al cierre de este boletín, Sernapesca mantiene disponibles las nóminas preliminares, sin que se haya publicado todavía en el portal específico una nómina definitiva de caducidades.

🔎 Impacto. La inclusión en una nómina preliminar no equivale a una caducidad ya declarada. El próximo paso será la resolución de los antecedentes aportados y la dictación de los actos definitivos, que pueden afectar directamente la permanencia de pescadores y embarcaciones en el Registro Pesquero Artesanal. Para quienes resulten finalmente afectados será necesario revisar tanto el fundamento concreto de la caducidad como las vías y plazos de impugnación disponibles.

3️⃣ Traspaso de cuotas: Dirección del Trabajo precisa el derecho a pago de patrones y tripulantes

El 11 de septiembre, la Dirección del Trabajo emitió el ORD. N° 415/33, relativo al pago que corresponde efectuar al patrón o a los tripulantes cuando el armador traspasa cuota de pesca conforme al inciso quinto del artículo 55 N de la LGPA.

El dictamen distingue según la naturaleza del vínculo existente. Si éste se rige por un contrato a la parte o sociedad a la parte, corresponde pagar la parte acordada en el respectivo contrato y las controversias sobre su exigibilidad son de competencia de los tribunales ordinarios con competencia civil. Si existe contrato de trabajo, en cambio, el pago correspondiente por el traspaso de cuota constituye remuneración en los términos del artículo 41 del Código del Trabajo y su cumplimiento puede ser fiscalizado por la Dirección del Trabajo.

El pronunciamiento agrega una precisión relevante: la LGPA no fija por sí sola el monto, fórmula de cálculo o modalidad de pago de esa remuneración. Su determinación debe efectuarse considerando el sistema remuneracional aplicable, las estipulaciones individuales o colectivas y los antecedentes de la respectiva cesión. Tampoco puede calificarse anticipadamente el pago como comisión o participación, pues ello dependerá de las condiciones de cada relación contractual.

🔎 Impacto. El dictamen despeja la naturaleza remuneracional del pago cuando existe contrato de trabajo y la competencia fiscalizadora de la Dirección del Trabajo, pero deja abierta una dificultad práctica importante: cómo determinar concretamente cuánto corresponde pagar por la cuota transferida cuando el sistema remuneracional o el contrato no regula suficientemente esa situación. En los contratos a la parte, el problema puede presentarse cuando el acuerdo regula la distribución del resultado de la pesca, pero no contempla una fórmula específica para el traspaso de cuota. Si existen controversias sustanciales sobre hechos, cláusulas contractuales o la fórmula de cálculo, su resolución excede las potestades fiscalizadoras de la Dirección del Trabajo.

4️⃣ Áreas marinas protegidas: Contraloría fija límites a los convenios de colaboración con entidades privadas

El 17 de septiembre, la Contraloría General de la República emitió el Dictamen N° D419N26, relativo a la elaboración de los Planes Generales de Administración de parques y reservas marinas. El pronunciamiento examinó, entre otros antecedentes, un Memorándum de Entendimiento celebrado por el Ministerio del Medio Ambiente, Subpesca y Sernapesca con The Pew Charitable Trusts y Conservation International.

Contraloría precisó que, durante el régimen transitorio establecido por la Ley N° 21.600, corresponde a Subpesca y Sernapesca elaborar los Planes Generales de Administración de los parques y reservas marinas comprendidos en dicho régimen. Entidades privadas pueden aportar estudios, información o asistencia técnica, pero las potestades públicas son irrenunciables y las prestaciones de apoyo susceptibles de externalización deben sujetarse a las reglas de contratación administrativa.

El órgano contralor observó que algunas actividades desarrolladas bajo el Memorándum —vinculadas con ejecución, gestión, asesoría, coordinación o difusión del proceso técnico y participativo— presentaban características propias de prestaciones de servicios y, en otros casos, podían involucrar funciones que corresponden directamente a la Administración. Asimismo, precisó que la gestión de la participación de interesados y comunidades debe permanecer en manos de los organismos públicos competentes.

🔎 Impacto. El dictamen obliga a los organismos involucrados a regularizar la situación y abstenerse de utilizar convenios de colaboración en los términos objetados, recurriendo a las reglas de contratación pública cuando corresponda contratar prestaciones de apoyo. Además, exige una participación efectiva, amplia e imparcial en la elaboración de los PGA, mencionando expresamente entre los interesados a pescadores artesanales y empresas del sector. Los organismos deberán informar a Contraloría las medidas adoptadas dentro de 90 días administrativos. El reclamo relativo a un eventual conflicto de interés fue desestimado por falta de antecedentes suficientes.

5️⃣ Jibia: continúa la discusión sobre una eventual modificación del régimen de artes de pesca

La Comisión de Intereses Marítimos, Pesca y Acuicultura del Senado continuó durante septiembre el estudio del Boletín N° 18.173-21, que busca modificar la LGPA para exceptuar a determinados armadores de la prohibición vigente en materia de artes y aparejos de pesca para la extracción de jibia.

Las audiencias continuaron los días 2 y 9 de septiembre con representantes de la pesca industrial, artesanal y organizaciones sectoriales. El 23 de septiembre la Comisión volvió a tratar la iniciativa, oportunidad en la que expuso además el Subsecretario de Pesca y Acuicultura.

🔎 Impacto. El proyecto incide en uno de los elementos que definen la actual estructura de explotación de la jibia: el arte de pesca autorizado y, con ello, el universo de operadores que puede acceder efectivamente al recurso bajo determinadas modalidades. Sin embargo, el régimen vigente no cambió durante septiembre. El alcance real de una eventual modificación dependerá del texto que surja de la discusión particular y de los trámites legislativos posteriores.

6️⃣ Seguridad marítima: continúa la votación particular del proyecto surgido tras el caso Bruma

La Comisión de Pesca, Acuicultura e Intereses Marítimos de la Cámara continuó durante septiembre la votación particular del proyecto sobre fortalecimiento de la seguridad marítima, Boletín N° 18.198-15.

La Comisión registró nuevos avances durante el mes, sin que la iniciativa quedara despachada. El proyecto forma parte de la respuesta legislativa desarrollada durante 2026 tras el caso Bruma y las conclusiones de la comisión investigadora de la Cámara sobre seguridad marítima y pesquera.

🔎 Impacto. La iniciativa puede traducirse en nuevas exigencias sobre seguridad, equipamiento, inspección, protocolos y control de embarcaciones. Su impacto dependerá especialmente de cómo el texto definitivo diferencie las obligaciones según las características y dimensiones de las naves. Esa cuestión es particularmente sensible para la pesca artesanal, donde exigencias uniformes pueden generar efectos económicos y operacionales distintos según el tamaño y capacidad de cada embarcación.

7️⃣ Pequeños pelágicos: cesiones y redistribuciones siguen modificando el acceso efectivo

Septiembre registró nuevas decisiones sobre anchoveta, sardina común y jurel. La Res. Ex. N° 2120-2026, publicada el 3 de septiembre, autorizó una cesión de anchoveta y sardina común en el área comprendida entre Biobío y Los Ríos. El 22 de septiembre se publicó una nueva cesión para esa misma zona mediante la Res. Ex. N° 2263-2026.

En Los Lagos, la Res. Ex. N° 2199-2026 modificó la distribución histórica de la fracción artesanal de anchoveta, sardina común y jurel para 2026. A ello se agregó la Res. Ex. N° 2202-2026, que fijó el período para los efectos del artículo 14 del D.S. N° 296 de 2004 respecto de distintas pesquerías artesanales sometidas a RAE.

Ese último mecanismo permite que determinadas variaciones en el número de pescadores o embarcaciones integrantes de las unidades de asignación sean comunicadas para producir efectos en futuras distribuciones, bajo las condiciones previstas en el reglamento.

🔎 Impacto. La cuota global no explica por sí sola cuánto puede capturar efectivamente cada actor. Cesiones, distribuciones regionales y cambios en la composición de las unidades de asignación pueden modificar durante el mismo ejercicio la disponibilidad concreta para organizaciones y embarcaciones. Septiembre confirma así la importancia de seguir no sólo las cuotas anuales, sino también los actos administrativos posteriores que determinan cómo éstas se utilizan y distribuyen.

8️⃣ Bacalao de profundidad: se establece un RAE por organización en Valparaíso

El Decreto Exento Folio DEXE202600163, publicado el 22 de septiembre, estableció un Régimen Artesanal de Extracción por Organización para la pesquería de bacalao de profundidad en la Región de Valparaíso.

La decisión incorpora a esa fracción artesanal a un mecanismo de administración basado en unidades de asignación por organización, cuya implementación deberá completarse mediante los actos de distribución correspondientes.

Durante la misma semana, Subpesca dictó además las Res. Ex. N° 2272 a 2278-2026, que otorgaron permisos extraordinarios de pesca para operadores de la unidad licitada de bacalao de profundidad y dejaron sin efecto resoluciones anteriores individualizadas.

🔎 Impacto. El RAE modifica la estructura bajo la cual se administra el acceso artesanal al recurso en Valparaíso, por lo que su relevancia excede una distribución anual de toneladas. En paralelo, la actualización de permisos extraordinarios modifica títulos habilitantes de operadores de la unidad licitada. Son decisiones distintas, pero ambas muestran actividad regulatoria relevante sobre una pesquería de alto valor y con regímenes diferenciados de acceso.

9️⃣ Certificación de desembarque: nuevas deudas activan suspensiones del artículo 64 E de la LGPA

Sernapesca publicó durante septiembre distintas resoluciones informando deudas por no pago de certificación de desembarque y disponiendo las suspensiones previstas en el artículo 64 E de la LGPA.

Las Res. Ex. DN N° 02707/2026 y DN N° 02772/2026 informaron nuevas situaciones de deuda durante la primera mitad del mes. El 23 de septiembre se publicó además la Res. Ex. DN N° 02890/2026, que identificó nuevos obligados y dispuso las suspensiones correspondientes.

🔎 Impacto. No se trata únicamente de una obligación económica pendiente. El artículo 64 E vincula la deuda con restricciones que, dependiendo del sujeto afectado, pueden incidir en el zarpe, la actividad de plantas o el ejercicio de derechos derivados de cuotas. Para quienes aparecen individualizados en estas resoluciones, la regularización de la deuda puede transformarse en una condición inmediata de continuidad operacional.

🔟 LTP clase B: aumento de cuotas genera cobros complementarios de anualidades

Subpesca informó el 14 de septiembre que el aumento de las cuotas globales de anchoveta y sardina común entre Valparaíso y Los Lagos modificó las anualidades 2026 correspondientes a las Licencias Transables de Pesca clase B que habían sido cobradas en marzo.

Como consecuencia del recálculo, los diferenciales adicionales quedaron disponibles para pago en la Tesorería General de la República. El ajuste deriva de las modificaciones efectuadas previamente a las cuotas 2026 de ambas pesquerías.

🔎 Impacto. Es el efecto económico directo de una modificación pesquera anterior sobre los titulares de LTP-B. Un aumento de disponibilidad de captura se traduce también en una modificación del costo regulatorio durante el mismo ejercicio, por lo que los titulares deben revisar los nuevos montos y su situación de pago.

1️⃣1️⃣ Pesquerías de arrastre: se modifica el protocolo de interacción con lobos marinos

La Res. Ex. N° 2212-2026, publicada el 14 de septiembre, modificó la Res. Ex. N° 3120-2021 que establece medidas y un protocolo para reducir la captura incidental y regular la manipulación de lobos marinos en pesquerías de arrastre.

La medida comprende las regiones desde Atacama hasta Magallanes y modifica reglas operacionales aplicables a la interacción de la flota con estos mamíferos durante las faenas de pesca.

🔎 Impacto. Aunque se trata de un ámbito más específico que las medidas anteriores, la resolución incide directamente en la forma en que deben desarrollarse determinadas operaciones de pesca de arrastre. El protocolo cumple simultáneamente una función de conservación y de cumplimiento regulatorio, por lo que sus modificaciones deben incorporarse a los procedimientos de operación de las flotas afectadas.

1️⃣2️⃣ COFI37: Chile participa en la agenda pesquera mundial y asumirá la presidencia del próximo período

Entre el 7 y el 11 de septiembre se celebró en Roma el 37° período de sesiones del Comité de Pesca de la FAO (COFI), principal foro intergubernamental mundial especializado en pesca y acuicultura.

La reunión abordó, entre otras materias, el estado mundial de la pesca y la acuicultura, pesca ilegal, no declarada y no reglamentada, ordenación pesquera, comercio, implementación de acuerdos internacionales, cambio climático y pesca de pequeña escala.

Para Chile, la reunión dejó además un resultado institucional relevante: el Subsecretario de Pesca y Acuicultura, Osvaldo Urrutia, fue elegido presidente del 38° período de sesiones del COFI.

🔎 Impacto. Las recomendaciones del COFI no sustituyen la legislación nacional ni producen por sí mismas cambios regulatorios en Chile. Su importancia está en que constituye uno de los principales espacios donde se construyen orientaciones internacionales que posteriormente pueden proyectarse sobre políticas públicas, organizaciones regionales de pesca, estándares de sostenibilidad y futuras regulaciones. La presidencia chilena del próximo período aumenta además el interés de seguir esta agenda, particularmente en materias como pesca INDNR, ordenación sostenible, cambio climático y pesca de pequeña escala.

1️⃣3️⃣ Aysén: detección de virus ISA deriva en una zonificación sanitaria obligatoria

El 17 de septiembre Sernapesca recibió la notificación de un resultado positivo al virus de la Anemia Infecciosa del Salmón (ISA) en el centro de cultivo Izaza, de Salmones Camanchaca, ubicado en la ACS N° 20 de la Región de Aysén. El Servicio inició inspecciones, muestreos y medidas preventivas mientras se verificaba el episodio.

Posteriormente, mediante la Res. Ex. N° 2901/2026, Sernapesca estableció una zona infectada y una zona de vigilancia alrededor del foco, incorporando restricciones de movimientos, mayores exigencias de bioseguridad, incremento de la frecuencia de muestreo y fiscalización de las operaciones asociadas a cosecha, traslado y descarga.

🔎 Impacto. El episodio pasó durante septiembre desde una detección bajo verificación a un régimen territorial obligatorio de control sanitario. Sus efectos no se limitan necesariamente al centro donde fue detectado el virus, porque las medidas de vigilancia y bioseguridad alcanzan también a instalaciones comprendidas dentro de la zonificación. El próximo elemento a observar será la evolución sanitaria de la ACS 20 y la eventual aparición de nuevos casos.

Procesos a seguir

Caducidades del Registro Pesquero Artesanal 2026. Cerrada la audiencia previa, el próximo hito será la dictación de las resoluciones definitivas. Será necesario revisar las causales finalmente aplicadas, las inscripciones afectadas y los mecanismos de impugnación que se utilicen.
Invalidación de la Res. Ex. N° 2563-2025 sobre incorporación de oficio al RPA. Continúa pendiente la resolución del procedimiento de invalidación iniciado por Subpesca. Mientras se tramita, Sernapesca mantiene suspendidas determinadas solicitudes de sustitución de embarcación y reemplazo voluntario de inscripción respecto de las pesquerías involucradas.
Jurel bajo condiciones oceanográficas variables. Corresponde seguir la aplicación del protocolo de áreas de resguardo, los resultados del nuevo método de control de talla mínima y el procedimiento de acreditación de origen legal, además de la evolución de las condiciones asociadas a El Niño.
Jibia. El proyecto continúa en primer trámite constitucional. El próximo punto relevante será el término de las audiencias y la definición del texto que avance en la discusión particular.
Seguridad marítima. La votación particular permanece abierta. Deberá observarse especialmente el alcance definitivo de las nuevas exigencias para embarcaciones artesanales y la forma en que se diferencien obligaciones según tamaño y tipo de operación.
Planes Generales de Administración de parques y reservas marinas. MMA, Subpesca y Sernapesca deberán adoptar medidas para ajustarse al Dictamen N° D419N26 e informar a Contraloría dentro del plazo de 90 días administrativos. Corresponderá observar cómo se regularizan los mecanismos de apoyo privado y de participación utilizados en estos procesos.
Tribunal Constitucional, requerimiento de EMDEPES, Rol N° 17.443-2026-INA. Permanece pendiente la decisión sobre la impugnación de normas de la Ley N° 21.752 relacionadas con el nuevo fraccionamiento entre los sectores artesanal e industrial. Una eventual sentencia tendrá efectos en la gestión pendiente en que se formuló el requerimiento, pero será observada también por su incidencia sobre la aplicación del nuevo régimen.
Virus ISA en Aysén. Observar la evolución de la zona infectada y de vigilancia establecida en la ACS 20, los resultados de los nuevos muestreos y la eventual necesidad de adoptar restricciones adicionales.